할 일 목록
2011-11-16 09:42:42

과제

클라우드 : 과제 발표 11.28 ~ 11.29

논문

프로그래밍 시작 및 매칭 작업.

OWL-EL 공부.

SNOMED-CT OWL-EL 변환 알아보기.

기타 표준안 검색.

수업

기계학습

바이오데이터마이닝 프로젝트

프로테제로 시티

연구윤리 3번

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한국어 search 기능 추가~!!
2011-11-16 09:36:05

마음을 먹은지 채 5분이 걸렸을까..?

http://blog.outsider.ne.kr/186

JEUS를 사용하다가 톰캣으로 넘어왔더니 GET방식으로 한글 파라미터를 넘기는 것이 되지 않았다. POST전송이야 알아서 되니까 괜찮고 GET방식으로 파라티터를 넘길 때 URL Encoding과정을 거쳐야 된다. 영문,숫자는 괜찮지만 특수기호나 한글이 들어가게 될 경우 주소창에 표시되는데 문제가 있기 때문에 URL Encoding해서 보내준다.

주소창에 %BF%D5%B1%E2%C3%E1 같은 형태로 쓰여진 것을 본적이 있을텐데 이것이 인코딩을 해준 것이다. 당연히 받을때는 디코딩을 해주고... 그냥 파라미터는 엔코딩한다고 생각하는게 차라리 맘편하다.

String encode(String s,String enc) 의 형태를 띄고 있다. 첫번째 파라미터는 엔코딩할 스트링이고 두번째 파라미터는 캐릭터 엔코딩 타입이다. URLEncoder.encode("블로그","utf-8") 와 같은 형태로 사용한다. URLEncoder는 java.net에 정의되어 있다.

근데 잘 돌아가던 것이 WAS를 변경해서 톰캣 5.5로 넘어왔더니 별 짓을 다해도 한글 GET파라미터가 도저히 먹지를 않았다.

톰캣설치폴더\conf\server.xml 파일에서 90~100라인정도에 보면 다음과 같은 내용이 있다.

Define a non-SSL HTTP/1.1 Connector on port 8080

Define a SSL HTTP/1.1 Connector on port 8443

URIEncoding="utf-8"

좋다.

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EMR용어 표준화-SNOMED CT 채택 늘어
2011-11-12 22:55:46

환자 및 국익을 위해 용어통일은 필수적

2006년 03월 05일 (일) 15:05:00 박현 hyun@kha.or.kr

전자의무기록(EMR)의 용어 표준화를 위해 개발 단계에서 반드시 국제적으로 인증된 용어집을 선택해 질병ㆍ증상 등의 용어 통일이 필요한 가운데 대형병원을 중심으로 "SNOMED CT(Systematized Nomenclature of Medicine Clinical Terms)"를 표준화된 용어집으로 선택하는 사례가 늘고 있다.

EMR 도입으로 차트가 없이도 언제 어디서나 환자기록 조회가 가능해졌고 모든 환자의 정보를 DB화해 의료정보가 표준화 됐으며 공유도 쉬워져 이 데이터를 연구자료로 활용할 수 있게 된 것은 엄청난 부가가치로 평가되고 있다. 그러나 EMR 개발이 개별 병원 중심으로 진행되고 있어 서로 다른 표준안이 채택되거나 표준화를 전혀 고려하지 않고 EMR을 개발하는 문제가 발생하고 있다.

이러한 가운데 국내 첫 100% 디지털병원을 구축한 분당서울대병원이 SNOMED CT를 선택한 데 이어 서울대병원ㆍ동국대병원을 비롯 최근 1천400병상 규모의 새병원을 신축하며 유비쿼터스병원을 천명한 세브란스병원도 표준용어로 이를 채택하고 있다.

SNOMED CT는 1965년에 개발된 이후 지금까지 40여년간 36만4천개의 임상개념 정보를 지닌 국제적으로 가장 완벽한 임상관련 분류체계로 발전되고 있으며 현재 30여개 국가에서 사용하고 있다. 특히 임상진료 용어 뿐 아니라 관련된 일반 용어를 대량으로 포괄하고 있어 CDW(Clinical Data Warehouse)에서 의미적 검색을 할 때도 효과적인 것으로 평가받고 있다.

SNOMED CT를 표준용어로 채택한 분당서울대병원 관계자는 "환자의 정보를 공유하고 이를 연구 데이터로 활용하는 것은 의무기록의 표준화 없이는 불가능한 일"이라며 "비록 EMR을 병원 단위에서 개별적으로 개발하고 있지만 환자를 위해서나 국익을 위해서라도 용어를 통일하는 작업은 반드시 필요하다"고 강조했다.

http://www.khanews.com/news/articleView.html?idxno=18577

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case study Pathologic finding
2011-11-11 10:18:15

The specimen received consisted of a portion of dura that was expanded

by a mixed inflammatory infiltrate as well as a small fragment of adherent

cerebral cortex. On low-power view the dura was thickened and fibrotic with

a slightly nodular architecture (Fig. 2). Closer inspection revealed a

mixed inflammatory infiltrate composed predominantly of lymphocytes and

plasma cells, but also containing neutrophils (Fig. 3). Interspersed and

occasionally in sheets were large, plump, pale histiocytes with abundant

finely vacuolated cytoplasm and eccentric nuclei. Scattered histiocytes

showed unequivocal intracytoplasmic lymphocytes and/or neutrophils

(emperipolesis) (Fig.4). Immunohistochemistry for S-100 protein showed

strong cytoplasmic staining of histiocytes and highlighted emperipolesis

(Fig 5). Histiocytes were negative for CD1a. Immunostains for B (CD20) and

T cells (CD3) demonstrated a mixed inflammatory infiltrate. Stains for

organisms (AFB and GMS) were negative.

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